Mọi người đã trải qua nhiễm trùng nghiêm trọng do ức chế hệ thống miễn dịch của abatacept; một số trong những bệnh nhiễm trùng đã gây tử vong Những người bị COPD có khả năng bị nhiễm trùng phổi thường xuyên hơn bình thường. Một số người đã có phản ứng phản vệ với thuốc. Abatacept có thể khiến các bệnh ung thư phát triển chậm phát triển và lan rộng, do sự ức chế của hệ thống miễn dịch.[3]

Các tác dụng phụ rất phổ biến (xảy ra ở hơn 10% số người) bao gồm nhiễm trùng đường hô hấp trên. Các tác dụng phụ thường gặp (xảy ra ở khoảng 1% đến 10% ở người) bao gồm nhiễm trùng đường hô hấp dưới, nhiễm trùng đường tiết niệu, nhiễm herpes, viêm phổi, cúm, ho, huyết áp cao, đau dạ dày, tiêu chảy, buồn nôn, nôn, đau dạ dày, loét miệng, transaminase tăng cao, phát ban, mệt mỏi, yếu, phản ứng tại chỗ tiêm và phản ứng tiêm toàn thân.[3]